dit is een samenvatting v het vak biochemie & moleculaire biologie door proffen van den eynde & derua.
met deze samenvatting haalde ik een 16 op het examen
Hoofdstuk 2: de chemie van de cel
2.1. Karakteristieken van koolstof
2.1.1. Het periodiek systeem der elementen
2.1.2. Valentie van biologisch belangrijke atomen
2.1.3. Karakteristieken van koolstof
2.1.4. Koolwaterstoffen
2.1.5. Geladen en polaire functionele groepen
2.1.6. C-bevattende moleculen kunnen stereoisomeren bevatten
2.1.7. Key technique: determining the chemical fingerprint of a cell
using mass spectrometry
2.2. Karakteristieken van water
2.2.1. Polair karakter
2.2.2. Waterstofbruggen zijn cohesief
2.2.3. pH
2.2.4. Oplosmiddel
2.3. Selectieve permeabiliteit van membranen
2.3.1. Structuur van membranen
2.3.2. Human connections: magnetic resonance imaging (MRI)
2.4. Synthese van macromoleculen door polymerisatie
2.5. Zelf-assemblage van macromoleculen
2.5.1. Primaire sequentie bepaalt conformatie
2.5.2. Sommige eiwitten hebben chaperonen nodig om op te vouwen
2.5.3. Zelfassemblage ook op hogere niveaus
2.5.4. Voordelen van hiërarchische assemblage
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, 2.1. Karakteristieken van koolstof
2.1.1. Het periodiek systeem der elementen
Groepen verticaal
Perioden horizontaal
Buitenste elektronen bepalen eigenschappen : elementen in zelfde groep : zelfde eig
C = ruggengraat v veel moleculen
2.1.2. Valentie van biologisch belangrijke atomen
Valentie-elektronen : aantal elektronen dat nodig is om octetstructuur te bereiken
2.1.3. Karakteristieken van
koolstof
Vormt 4 covalente
bindingen met zichzelf of andere atomen
C – bevattende moleculen zijn stabiel
Bindingsenergie (= energie vereist om een 1 mol van bindingen te
breken (~6x x 1023) uitgedrukt in kcal/mol)
Energie om covalente binding te breken:
C-C -- 83
C-N – 70
C-O – 84
C-H – 99
C=C – 146
C=-C – 212
Thermische energie = energie van willekeurige beweging van atomen en
moleculen
Bij infrarood & zichtbaar licht : bindingen breken niet
Zichtbaar licht : ~400 nm tot ~700nm
Bij UV-licht = gevarenzone : bindingen breken (bv in huid) mutaties in DNA
2.1.4. Koolwaterstoffen
enkel C & H
benzeen : grote stabiliteit
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