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Samenvatting Hoofdstuk 18 - genexpressie I. transcriptie

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dit is een samenvatting v het vak biochemie & moleculaire biologie door proffen van den eynde & derua. met deze samenvatting haalde ik een 16 op het examen

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  • 29 février 2024
  • 18
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lukavervoort
Hoofdstuk 18 - genexpressie I. transcriptie
Hoofdstuk 18 - genexpressie I. transcriptie............................................................................................1
De richting van de genetische informatiestroom...............................................................................3
Genetisch materiaal.......................................................................................................................3
Uitzonderingen op centrale dogma................................................................................................4
Het mechanisme van transcriptie......................................................................................................4
Overzicht van transcriptie..............................................................................................................4
Prokaryoten...................................................................................................................................5
RNA polymerase :.......................................................................................................................5
Consensussequenties v bacteriële promotor.............................................................................5
Initiatie vd RNA synthese...........................................................................................................5
Elongatie vd RNA streng.............................................................................................................6
RNA proeflezing.........................................................................................................................6
Terminatie v RNA synthese........................................................................................................6
Eukaryoten.....................................................................................................................................6
Promotor voor RNA pol I............................................................................................................7
Promotor voor RNA pol II...........................................................................................................7
Promotor voor RNA pol III..........................................................................................................7
Pre-initiatie complex..................................................................................................................7
Elongatie & terminatie...............................................................................................................8
Key technique : hunting for DNA-protein interactions...............................................................9
RNA processing & turnover..............................................................................................................10
rRNA synthese..............................................................................................................................10
Eukaryotische rRNA synthese...................................................................................................10
NORs........................................................................................................................................11
Pre-rRNA processing....................................................................................................................11
Bij eukaryoten..........................................................................................................................11
Bij prokaryoten.........................................................................................................................11
Eukaryotische pre-rRNA processing.............................................................................................12
snoRNAs vormen snoRNPs.......................................................................................................12
Nucleolus : ribosoomfabriekje bij eukaryoten.........................................................................12
Pre-tRNA processing....................................................................................................................12
Pre-mRNA processing..................................................................................................................13
5’ capping.................................................................................................................................13
3’ polyadenylering....................................................................................................................13

1

, Pre-mRNA splicing....................................................................................................................13
Spliceosomen.......................................................................................................................14
Exon-junction complex (EJC)................................................................................................15
GU-AG / AU-AC / self-splicing introns...................................................................................15
Alternatieve splicing.................................................................................................................15
Exon – shuffling....................................................................................................................16
Exon – duplicatie..................................................................................................................16
Verschillende subnucleaire structuren in de celkern............................................................16
RNA editing..............................................................................................................................16
RNA editing in humaan APOB gen........................................................................................17
Insertie RNA editing bij Trypanosoma..................................................................................17
DNA editing..............................................................................................................................17
Pre-mRNA processing is co- & post-transcriptioneel proces........................................................18
MRNA metabolisme.....................................................................................................................18
Amplificatie..................................................................................................................................18




2

, De richting van de genetische informatiestroom
De plaats waar transcriptie & translatie plaatsgrijpt is verschillend tussen
prokaryoten & eukaryoten




Prokaryoten : gelijktijdige transcriptie & translatie

Eukaryoten : transcriptie & translatie ruimtelijk gescheiden

Eukaryote cellen hebbe, een kern waardoor er een ruimtelijke scheiding is v transcriptie &
translatie

Genetisch materiaal
Prokaryoten & eukaryoten  DNA genoom

Virussen  DNA of RNA genoom

RNA virussen hebben RNA als genoom:

 (+) ssRNA virussen : tabaksmozaïekvirus, SARS-CoV-2 virus
 (-) ssRNA virussen : influenzavirus
 Retrovirussen hebben 2 identiek (+) ssRNA strengen : HIV, RNA
tumorvissen
 Ds RNA virussen : rotavirus

DNA virussen hebben DNA als genoom:

 Ds DNA virus : human papilloma virus, meeste bacteriofagen




3

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