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Samenvatting Hoofdstuk 20 - regulatie van genexpressie

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dit is een samenvatting v het vak biochemie & moleculaire biologie door proffen van den eynde & derua. met deze samenvatting haalde ik een 16 op het examen

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  • 29 février 2024
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lukavervoort
Hoofdstuk 20 – regulatie van genexpressie
Hoofdstuk 20 – regulatie van genexpressie ............................................................................................ 1
Regeling v genexpressie in bacteriën .................................................................................................. 2
Lac operon v E. coli.......................................................................................................................... 2
Trp operon....................................................................................................................................... 5
Sigmafactoren ................................................................................................................................. 5
Riboschakelaars = riboswitches ...................................................................................................... 8
CRISPR/CAS systeem beschermt bacteriën tegen virale infecties................................................... 8
Regeling v genexpressie in eukaryoten: genomische controle (1e niveau) ......................................... 9
De verschillende celtypen hebben zelfde genoom (genomic equivalence) .................................... 9
Uitzonderingen v genomic equivalence in zeer specifieke celtypes: ............................................ 11
(de)condensatie graad vh chromatine is verschillend tussen de verschillende celtypeen ........... 12
De verschillende celtypen verschillen in hun epigenoom ............................................................. 12
Regeling v genexpressie in eukaryoten : transcriptionele controle (2e niveau) ................................ 15
Algemene & regulerende transcriptiefactoren (TF) ...................................................................... 15
Structuur v DNA-bindingsdomeinen v regulerende TF ................................................................. 17
Gecoördineerde genexpressie door binding ve TF op een DNA respons element ....................... 18
Regeling van genexpressie in eukaryoten : post-transcriptionele controle (3e-4e-5e niveau) ........... 21
3e niveau : controle v RNA processing & nucleair export ............................................................. 21
4e niveau : translationele controle ................................................................................................ 22
5de niveau: post translationele controle........................................................................................ 26




1

,Regeling v genexpressie in bacteriën
Constitutieve genen : genen komen constant tot expressie
Bv ribosomale genen of genen die coderen voor de enzymen vd glycolyse
Gereguleerde genen : expressie v genen geregeld door omgevingsfactoren
- Genen die coderen voor enzymen v metabole paden die niet constant nodig zijn
- 2 typen v regulatie :
▪ Katabole (afbraak) paden : substraat inductie
▪ Anabole (synthese) paden : repressie door eindproduct
- Hoe? Via DNA bindende eiwitten die al dan niet allosterisch geregeld worden
Katabole paden : bv lactose afbraak (lac operon)
Het enzym β-galactosidase hydrolyseert het disaccharide lactose in
monosacchariden : glucose + galactose
Substraat inductie : β- galactosidase zal gesynthetiseerd worden als lactose
aanwezig is ( als niet aanwezig : geen β-galactosidase want verspilling v energie)


Anabole paden : bv tryptofaan synthese (Trp operon)
Hoeveelheid enzyme omgekeerd evenredig met hoeveelheid eindproduct => veel tryptofaan :
synthese vd enzymen nodig voor tryptofaan synthese daalt
Repressie door eindproduct → doet genexpressie v bepaald enzym dalen
≠ als feedback inhibitie (=enzym geblokkeerd door eindproduct)
Lac operon v E. coli
Operon = groep v genen die coderen voor eiwitten met gerelateerde functies liggen naast elkaar &
worden samen afgeschreven : polycistronische mRNA wordt gevormd dat codeert voor meerdere
eiwitten
Typisch voor prokaryoten , minder in eukaryoten (↘weten wat codeert voor wat!!)




Repressor proteïne : eigen promotor – behoort niet tot lac mRNA
Lac operon : negatieve regulatie door lac repressor
Lac I gen : codeert voor repressor = DNA bindend eiwit → bindt operator & blokkeert expressie
= allosterisch
proteïne




2

, MAAR ook induceerbaar = substraat inductie → inducer = isomeer v lactose : allolactose




= conformatieverandering v repressor




Belangrijke tabel : kennen & begrijpen!!




Analyse :
Genotype :
- X+ = wild type = normaal
- X- : defect
Fenotype
- + : wilt type → normaal functionerend eiwit is aanwezig
- - : geen eiwit of niet functionerend eiwit aanwezig
Mutatie in operon genen :
- Z- codeert voor een defect eiwit
- Y- codeert voor een defect eiwit
Mutatie in regulatorische regio’s vh lac operon :
- Oc : constitutieve promotor = lac repressie kan niet binden → constante transcriptie

3

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