Deze samenvatting bevat alle belangrijkste punten van het vak moleculaire biologie (B-B1MB05).
Alle onderdelen zijn ordelijk onder elkaar uitgezet en worden kort maar krachtig toegelicht om efficiënt te leren.
De samenvatting komt voort uit: aantekeningen, werkcolleges, leerdoelen en teksten uit...
H2 – atomen en moleculen
𝒙
𝒚𝒁
• X= atoommassa [p+n → isotopen ander aantal neutronen maar reageren hetzelfde in chemische reactie]
• Y= atoomnummer [aantal p+; bepaald identiteit atoom / aantal e-; vermogen bindingen te vormen]
o Valentie elektronen: e- in buitenste schil= aantal te maken bindingen
▪ zelfde valentie elektronen als in zelfde kolom in periodiek systeem
o Lewis structuur: bindingen en vrije-elektronenparen
➔ Octeregel: molecuul streeft naar edelgasconfiguratie= buitenste e—schil vol (covalente binding=2)
➔ Volle valentie-schil dan inert, reageert niet/nauwelijks
Radioactieve isotopen: onstabiel, radioactief verval naar ander atoom 1n-->1p+ + 1e-
- Halveringstijd= 50% vervallen van ouder --> dochter isotoop F=o.5x
▪ F=o.5x met F=fractie, x=n halfwaardetijden
Elektronenschil= energie level, e- verplaatsen alleen als verloren/verkregen energie gelijk is aan verschil 2 lagen
- e- bevat potentiële energie: hogere schil= E opgenomen / lagere schil= E verloren
1e schil= 2 elektronen max Per orbitaal 2 e-
2e schil= 8 elektronen max --> 1s
3 schil= 8 elektronen max
e
--> 2s, 2px, 2py, 2pz
➔ reactiviteit atoom door ongepaarde elektronen in orbitaal
BINDINGEN
• covalente: gemeenschappelijk elektronenpaar (delen verbonden orbitaal)
- apolair: lading opgeheven door symmetrie ∆EN<0.5
- polair: 𝛿 + en 𝛿 - 0.5<∆EN<1.6
➔ elektronegativiteit hoger als element meer rechtsboven in periodieksysteem staat
➔ O>N>C>H
• ion- (zout): elektrostatische aantrekking +atoom (kation) en -atoom (anion)
• waterstofbrug: tussen moleculen, partiële lading H2O, NH3 OH+2---N-H3
• van der Waals: ongelijke lading verdeling in atoom, sterker bij groter molecuul
H3 – chemie van water [H2O]
H2O
- polair molecuul [𝐻 𝛿+ en 𝑂𝛿− ]
- onderlinge waterstofbruggen [bij ijs vast in kristalstructuur]
▪ O kent 4 orbitalen in valentieschil, 2 gedeeld in covalente binding met H, 2 over voor H-brug
- hoge oppervlaktespanning door cohesie watermoleculen
▪ adhesie: aantrekkingskracht 2 verschillende stoffen
- thermische energie opslag [1 calorie= 1gram H2O + 1C°]
▪ hoge soortelijke warmte= weinig temp. Verandering als H2O warmte afgeeft/opneemt
▪ Hitte afgeven= H-brug vormen
▪ Hitte absorberen= H-brug verbreken
▪ hoge verdampingswarmte zorgt voor verdampingskoeling oppv. [energie voor 1gram (l) --> (g)]
Oplossing: homogeen mengsel vloeistof met >2 opgeloste stoffen
- waterige oplossing: H2O= oplosmiddel (hydratie vormt hydraat van ion)
- hydrofiel: lost goed op in H2O (ionisch/polair)
1. waterstofion H+ (hydrogen) [H+][OH-]=10-14 --> lage pH=zuur=veel H+
2. hydroxide ion OH -
[H ]=10
+ -pH
3. hydronium ion H3O+ pH=-log[H+] → sterk
- zuur: geeft H af+
← zwak (evenwicht)
→
- base: neemt H+ op “geconjugeerde…”
- buffers: enzym regulatie
▪ zodat carboxy (-COOH) en amino (NH2) groep niet ioniseren van aminozuren
, H4 – basis van moleculaire diversiteit
• 1mol= molecuulmassa in u
• Molariteit (M)= gram/u (1L water= 1000gram)
• Organisch: bevat C-atomen [koolwaterstof= alleen C-H]
- Methaan CH4
- Ethaan C2H6 etheen C2H4 / ethyn C2H2
- Propaan C3H8 tetraëders: viervlak bij enkele binding
- Butaan C4H10
Isomeer: zelfde molecuulformule, andere structuurformule & ruimtelijke structuur
1. Structuur-: atomen verschillende volgorde verbonden/gearrangeerd
2. Cis-/trans- [geometrisch]: dubbele binding, 2-atoom(groepen) wisselen
▪ Cis= 2 groepen aan dezelfde kant
▪ Trans= 2 groepen aan tegenovergestelde kant
3. Optische- / spiegelbeeld-[enantiomerie]: asymmetrisch C-atoom (chiraal)= C met 4 verschillende atoomgroepen
▪ Aminozuren kennen 2-enantiomeren (allen L-vorm voor eiwitsynthese --> -OH links van chiraal C-atoom)
ATOOMGROEP MOLECUULFORMULE NAAM & EIGENSCHAP
hydroxyl -OH Alcohol (-ol) --> polair voor grotere oplosbaarheid
carbonyl C=O Keton (in C-skelet) of aldehyde (aan einde C-skelet)
carboxyl -COOH Carbonzuur= organisch zuur geeft H+ af
amino -NH2 Amine= base neemt H+ op
sulhydryl -SH Thiol, vormen crosslinks
Fosfaat -OPO32- Organisch fosfaat, reageert met water
methyl -CH3 Methylering bepaalt expressie van genen in DNA
ATOOM ATOOMNUMMER VALENTIE-e- ∆EN
O 8 (2,6) 2
---------->
N 7 (2,5) 3
C 6 (2,4) 4
H 1 (1) 1
Zuur/base pH berekenen Vb.
waterstofion H+ (hydrogen) [H+][OH-]=10-14 [10-2][10-12]=10-14
[H+]=10-pH
hydroxide ion OH- pH=-log[H+] [H+]=10-7
hydronium ion H3O+ 7=-log[10-7]
Figuur 1 structuurformule ATP
Adenine + ribose + 3 fosfaatgroepen
Les avantages d'acheter des résumés chez Stuvia:
Qualité garantie par les avis des clients
Les clients de Stuvia ont évalués plus de 700 000 résumés. C'est comme ça que vous savez que vous achetez les meilleurs documents.
L’achat facile et rapide
Vous pouvez payer rapidement avec iDeal, carte de crédit ou Stuvia-crédit pour les résumés. Il n'y a pas d'adhésion nécessaire.
Focus sur l’essentiel
Vos camarades écrivent eux-mêmes les notes d’étude, c’est pourquoi les documents sont toujours fiables et à jour. Cela garantit que vous arrivez rapidement au coeur du matériel.
Foire aux questions
Qu'est-ce que j'obtiens en achetant ce document ?
Vous obtenez un PDF, disponible immédiatement après votre achat. Le document acheté est accessible à tout moment, n'importe où et indéfiniment via votre profil.
Garantie de remboursement : comment ça marche ?
Notre garantie de satisfaction garantit que vous trouverez toujours un document d'étude qui vous convient. Vous remplissez un formulaire et notre équipe du service client s'occupe du reste.
Auprès de qui est-ce que j'achète ce résumé ?
Stuvia est une place de marché. Alors, vous n'achetez donc pas ce document chez nous, mais auprès du vendeur Marissa18. Stuvia facilite les paiements au vendeur.
Est-ce que j'aurai un abonnement?
Non, vous n'achetez ce résumé que pour €3,99. Vous n'êtes lié à rien après votre achat.
