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Summary PCA advanced data analysis

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Summary of 6 pages for the course advanced data analysis at UA (Summary lesson PCA)

Aperçu 2 sur 6  pages

  • 8 juin 2024
  • 6
  • 2023/2024
  • Resume
Tous les documents sur ce sujet (19)
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AVL2
PCA
First step to look at your data
-> reasons to do PCA
 Dimension reduction
 Visual and mathematical results
 What are the underlying dynamics of my system?
 Is there different groupd in my samples?
 QC

Multivariate data = short and wide table with too many variables for a
clear overview
-> complex data, how to represent this data

Data transformation: variables need to be preprocessed before being of
use
Log transformation (take the log of each datapoint)




Normalization: sometimes you need to normalize the values of a
variable-> make variables comparable




Comparison between variables: when you use patterns, outliers become
visible which would be not the case when you would look at the individual
plots

Covariance = how much do two variables change together? Can take up
any value
 0 = no relation between the variables
 + = similar behaviour
 - = inverted behaviour

Correlation = measures both the strength and direction of the linear
relationship between two variables. It is a normalized version of
covariance. -1  1
 0 = no correlation
 -1 = perfect inverted correlation

,  1 = perfect correlation

Causation = change in one variable means a direct change in the other
variable
Compare set of sick people with set of healthy people
-> find the variables correlated with the disease
-> you find factors that are not directed related to the disease but are a
consequence of the disease


Data projection
Multivariate analysis by projection: why?
-> looks at all the variables together
-> avoid loss of information
-> find underlying trends
-> more stable models
-> unsupervised


What is a projection:
You want to reduce dimensionality of the data + algebraic interpretation
(summary of observation variables into a few new artificial variables
Geometric interpretation:
 Variables form axes in a multidimensional space
 A single observation in this space = a point
 These points will be projected on a plane




Why would you use projections?
-> reduce dimensionality without the loss of information
-> handle different types of data sets
-> handles correlation variables
-> graphical results
-> separates actual trends from noise

PCA
-> data visualization and simplification
 Info stays in the correlation structure of the data
 Projection to a lower dimensionality

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Foire aux questions

Qu'est-ce que j'obtiens en achetant ce document ?

Vous obtenez un PDF, disponible immédiatement après votre achat. Le document acheté est accessible à tout moment, n'importe où et indéfiniment via votre profil.

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Auprès de qui est-ce que j'achète ce résumé ?

Stuvia est une place de marché. Alors, vous n'achetez donc pas ce document chez nous, mais auprès du vendeur AVL2. Stuvia facilite les paiements au vendeur.

Est-ce que j'aurai un abonnement?

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