Geen zin om een samenvatting te maken en geen zin om tijd te steken in het boek van biochemie? Dan is deze samenvatting perfect voor jou!
Dit is een samenvatting van het boek van Biochemie geschreven door prof. Van Lint. Ook staan er extra dingen bij die in de ppt's tijdens de les zijn gezegd e...
H1 BIOMOLECULEN
20 AMINOZUREN
1. Non-polair, alifatisch
- Glycine (Gly)
o Niet-asymmetrisch
o Geen zijketen (H)
o Conformationele flexibiliteit
- Alanine (Ala), Valine (Val), Leucine (Leu), Isoleucine (Ile), Mathionine (Met)
o Inert, alifatisch
o Non-polair, hydrofoob
o Geen functionele groepen
o Clusteren zijketens -> structuur stabiliseren (hydrofobe interacties)
o Verschillende vormen -> structuur door ruimte
2. Aromatisch
- Fenylaline (Phe)
o Benzeenring
o Hydrofoob, weinig reactief
o Apolair
- Tyrosine (Tyr)
o Intermediair polair
o Waterstofbruggen
o OH-groep = belangrijk functionele groep + belangrijk voor fosforylatie (door
tyrosinekinasen -> signaaltransductie)
- Tryptofaan (Trp)
o Intermediair polair (N in indolring)
o Grootste zijketen
o Zeldzaam
--> absorberen uv-licht (280nm) -> concentratie bepalen, zuiveringsproces
3. Polair, ongeladen
- Cysteïne (Cys)
o Sulfylhydryl R-groep (SH) -> polair (pKa 8,2)
o Ioniseert op licht
o Oxidatie -> disulfide (cystine)
o Disulfidebruggen -> 3D-structuur eiwit -> stabiliserend
o Katalytisch centrum van enzyme
o Ionisatie SH -> S- + H+ -> sterk nucleofiele zwavelgroep
- Serine (Ser), Threonine (Thr)
o OH-groep -> polair
o Waterstofbruggen (H-donor of H-acceptor)
o Fosforylatie -> signaaltransductie
- Asparagine (Asn), Glutamine (Gln)
o Amiden van asparaginezuur en glutaminezuur
o Relatief polair
, o Waterstofbruggen (H-donor of H-acceptor)
- Proline (Pro)
o Cyclisch, ongeladen
o Rigide conformatie (vanwege ring)
o Geen waterstofbruggen
o Speciale structuur (knik) -> cisconfiguratie
4. Positief geladen
- Arginine (Arg)
o Guanidinogroep (positief geladen)
o pKa = 10 -> sterk positief geladen
- Lysine (Lys)
o Primair amine
o pKa = 10 -> sterk positief geladen
- Histidine (His)
o Imidazol
o pKa = 7
o Elektrofiele N = H-donor
Nucleofiele N = H-acceptor
o Nucleofiele katalysator -> katalytisch centrum
o Niet-geladen vorm = protonacceptor
Geladen vorm = protondonor
o Veelzijdige eigenschappen
5. Negatief geladen
- Aspraginezuur (Asp), Glutaminezuur (Glu)
o Carboxylgroepen
o pKa (Asp) = 3, pKa (Glu) = 4
o volledig geïoniseerd bij pH 7-> zeer polair
o sterk negatief -> kationen en metalen cheleren (complexvorming)
SUIKERS
Mono- en disachariden
o D-glucose
o D-galactose: hydrolyse van lactose
o D-fructose
o D-ribose: nucleïnezuren
o Maltose: 2 glucoses
o Lactose: glucose + galactose
o Sucrose: fructose + glucose
- Suikerzuren: ‘-uronzuur’, ‘-onzuur’
o Glucuronzuur
o Gluconzuur
o gluconolaction
- Suikeralcohols: reductie van carbonylgroepen
o Sorbitol
o Glycerol
, o Ribitol
- Deoxysuikers : 1 zuurstof minder
- Suikerresten
- Aminosuikers: aminogroep
o Muraminezuur
o Neuraminezuur
Polysachariden: homo- of hetero-
o Zetmeel: aardappel
o Glycogeen: lever
§ Korte takken -> monomeren glucose uit te halen
o Cellulose: celwand plant
§ Lineair, onvertakt
§ Onverteerbaar
§ Waterstofbrugvorming -> grote sterkte
§ Stabiel
o Chitine: exoskeletten
§ Onverteerbaar
- Peptidoglycans: in bacteriële celwand
§ Peptide-crosslinks -> sterke wand
§ <-> lysozome en penicilline
- Glucosaminoglycans (GAG’s)
§ Herhaalde disachariden
§ N-acetylglucosamine of N-acetylgalactosamine met -uronzuur
§ Soms sulfaat -> negatief -> afstoting -> lineaire structuur (minimaliseren
van afstotingen)
§ Extracellulaire matrix -> ‘jungle’
§ Gesulfateerd en niet-gesulfateerd -> specifieke herkenning
proteïneliganden -> elektrostatisch binden
§ Covalent binden met proteïnen -> proteoglycans
o Hyaluronzuur
§ Glasachtig, translucent
§ Viskeus
§ Glijmiddel
§ Spankracht in extracellulaire matrix
§ Hyaluronidase (enzyme): splitsen -> verder doordringen bacteriën in
weefsels (zie ook zaadcellen tot eicel)
o Chondroïtinesulfaat
§ ‘gewricht’
§ Spansterkte
o Dermatansulfaat
§ ‘huid’
§ Plooibaarheid
o Keratansulfaten
§ ‘hoorn’
§ Geen -uronzuur
§ In hoornachtige structuren gevormd door dode cellen
o Heparine
, § ‘lever’
§ Anticoagulans -> sterk elektrostatisch
Glycoconjugaten: suikerpolymeren en eiwitten of lipiden
- Proteoglycans
o Macromoleculen in plasmamembraan of cellulaire matrix
o GAG-moleculen vastgehecht aan ‘core-proteïne’ (trisacharidebrug)
o Voorzien van mutipele bindingsplaatsen -> elektrostatische binding of
waterstofbruggen
o Bindweefsel (bv. kraakbeen) -> covalente interacties
o Aggrecans (complexen van meerdere core-proteïne) -> collageen binden ->
spankracht
o Integrale membraaneiwitten (bv syndecan) -> connectie tussen extracellulair
en intracellulair -> genexpressie beïnvloeden
o Onvertakte suikers
- Glycoproteïnen
o Kleiner, diverser dan GAG’s en proteoglycans
o Alle mogelijke functionele klassen van eiwitten
o O-linked of L-linked
o Vertakte suikers
o Complexer
o Hexosen, acetyl hexosamines, pentosen, methylpentosen, siaalzuren
o Functies
§ Modulatie: oplosbaarheid, viscositeit,...
§ Bescherming tegen proteolyse
§ Beïnvloeden proteolytische processing
§ Biologische activiteit
§ “reisaspecten” -> insertie, migratie,...
§ Embryonale ontwikkeling en secretie
§ Invloed metastasering van tumorcellen (uitzaaiing)
- Glycolipiden
o Gangliosiden
§ Membraanlipiden
§ Complexvorming
§ Bv. bloedgroepantigenen
o Lipopolysachariden (LPS)
§ Buitenste membraan gramnegatieve bacteriën (bv. E. coli)
§ Primaire doelwitten van antistoken
§ Serotypes (specifieke antistoken) bepaald door samensteling LPS
§ Toxisch -> infectie -> bloeddrukdaling -> ‘toxic shock syndrome’
- Lectines
§ Cel-herkenning + adhesie
§ Lectine (selectine) herkennen T-lymfocyt -> vertragen
§ Herkenning glycolipiden of glycoproteïnen
§ Virale lectine
§ Toxine als lectine
§ Als bacteriële vasthechting
VETTEN
Les avantages d'acheter des résumés chez Stuvia:
Qualité garantie par les avis des clients
Les clients de Stuvia ont évalués plus de 700 000 résumés. C'est comme ça que vous savez que vous achetez les meilleurs documents.
L’achat facile et rapide
Vous pouvez payer rapidement avec iDeal, carte de crédit ou Stuvia-crédit pour les résumés. Il n'y a pas d'adhésion nécessaire.
Focus sur l’essentiel
Vos camarades écrivent eux-mêmes les notes d’étude, c’est pourquoi les documents sont toujours fiables et à jour. Cela garantit que vous arrivez rapidement au coeur du matériel.
Foire aux questions
Qu'est-ce que j'obtiens en achetant ce document ?
Vous obtenez un PDF, disponible immédiatement après votre achat. Le document acheté est accessible à tout moment, n'importe où et indéfiniment via votre profil.
Garantie de remboursement : comment ça marche ?
Notre garantie de satisfaction garantit que vous trouverez toujours un document d'étude qui vous convient. Vous remplissez un formulaire et notre équipe du service client s'occupe du reste.
Auprès de qui est-ce que j'achète ce résumé ?
Stuvia est une place de marché. Alors, vous n'achetez donc pas ce document chez nous, mais auprès du vendeur paulien15694. Stuvia facilite les paiements au vendeur.
Est-ce que j'aurai un abonnement?
Non, vous n'achetez ce résumé que pour €11,16. Vous n'êtes lié à rien après votre achat.
