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Samenvatting hoofdstuk 5 enzymologie: Mechanisme van katalyse, 2e bachelor biomedische wetenschappen

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Samenvatting hoofdstuk 5 enzymologie: Mechanisme van katalyse 2e bachelor Biomedische wetenschappen

Aperçu 2 sur 7  pages

  • 20 mars 2024
  • 7
  • 2022/2023
  • Resume
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lottehulselmans
Hoofdstuk 5: Mechanisme van katalyse

Indeling enzymen

6 hoofdklassen obv soort reactie ze katalyseren:

1) Oxido-reductasen: elektronentransfer
2) Transferasen: groeptransfer reacties vb. fosforylering
3) Hydrolasen: hydrolysereacties (transfer van functionele groep naar water)
4) Lysasen: klieving van C-C, C-O, C-N of andere bindingen bij eliminatie, dubbele bindingen
achterlaten, of additie van groepen naar dubbele binding
5) Isomerasen: transfer van groepen binnenin moleculen naar isomere vormen
(intramoleculaire herschikkingen)
6) Ligasen of synthasen: vorming C-C, C-S, C-O en C-N bindingen door condensatiereacties
gekoppeld aan klieving van ATP of andere cofactor (energie vereist)

Naamvorming gebaseerd op waargenomen chemische reactie




Co-enzymes, vitamines en metalen

Enzymes hebben hulp nodig van kleinere moleculen = cofactoren  3 types:

1) Co-enzymes
 organische factoren niet-covalent gebonden
 afgeleid van vitaminen
 kan na de reactie vrijgesteld worden als 1 van de producten
2) Prosthetische groepen
 organische factoren covalent gebonden
 wordt in zijn oorspronkelijke toestand hersteld tijdens de reactie
 permanent gelinked aan het enzym
3) Metalen

, Holo-enzym = compleet katalytisch actief enzym met zijn gebonden co-enzym en/of metaalionen

Apo-enzym = eiwitgedeelte van zo’n enzym

Co-enzymen

Voorbeeld 1: NAD+ is co-enzyme met vitamine B3 als precursor

Niacin = vitamine B3 = precursor voor NAD+

Functie = overdracht elektronen en N+ atomen

Alcohol dehydrogenase gebruikt NAD+ als co-enzym om ethanol om te zetten naar acetaldehyde:



Voorbeeld 2: UDP-galactose-4-epimerase

UDP galactose omzetten naar UDP glucose met NAD+ als co-enzym




hydroxylgroep wisselt van positie

Prostetische groepen:

 Flavine adenine dinucleotide (FAD)
Reactieve stikstofatomen:
elektronendonor of -acceptor
Flavinegroep covalent gebonden aan
enzym

 Lipoylzuur

Disulfidebrug reactief -> zorgt voor functionele
werking: acylgroep opnemen en doneren
Hefboom mechanisme: acylgroep kan ergens
weggenomen worden en veel verder terug worden
ingebouwd

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