In dit document is de leerstof van Moleculaire Biologie te zien per thema. Aan het eind van het document zijn overzichtstabellen te zien van alle eiwitten, mutaties en herstel mechanismen die in de cursus behandeld zijn.
Summary Molecular Biology of the Cell (5234MOBC6Y) partial exam 1+2
Notes for all lectures of cell metabolism and metabolic control
Tout pour ce livre (21)
École, étude et sujet
Hogeschool Utrecht (HU)
Life Science & Technology
Moleculaire biologie (TLSCMOLBIO3V20)
Tous les documents sur ce sujet (4)
Vendeur
S'abonner
emmavandervelden79
Aperçu du contenu
Samenvatting molbio
Inhoud
THEMA 1.............................................................................................................................................................2
De structuren van DNA en RNA kan onderscheiden en beschrijven...............................................................2
Primers kan ontwerpen en de zaken waar rekening mee gehouden moet worden kan uitleggen.................4
De processen en de regulatie van DNA replicatie initiatie, elongatie en terminatie kan uitleggen en de
verschillen tussen pro -en eukaryoten kan benoemen...................................................................................5
THEMA 2...........................................................................................................................................................12
Regulatie van het lac operon kan uitleggen en de toepassing hiervan in blauw-wit screening....................15
DNA bindende domeinen kan herkennen en rol in DNA binding kan uitleggen...........................................19
Epigenetische begrippen zoals histon- en DNA modificaties kan uitleggen en de rol hiervan in genexpressie
......................................................................................................................................................................19
De functie, structuur en synthese van verschillende typen (small) RNAs kent.............................................22
THEMA 3...........................................................................................................................................................27
THEMA 4...........................................................................................................................................................32
Eiwitten.............................................................................................................................................................42
Mutaties...........................................................................................................................................................44
Pre-replicatief herstel.......................................................................................................................................44
Post replicatief herstel......................................................................................................................................44
Oefentoets........................................................................................................................................................45
,THEMA 1
De structuren van DNA en RNA kan onderscheiden en beschrijven
DNA is een rechtsdraaiende complementaire
helix. DNA is opgebouwd uit nucleotides: bestaan
uit een fosfaatgroep + suikergroep + base. De ene
streng loopt van ‘3 naar ‘5, de andere streng ‘5
naar ‘3. Op het 2e koolstof atoom van DNA ligt
een H (deoxyribose). Op het 2e koolstof atoom
van RNA ligt een OH (ribose). DNA en RNA
opgebouwd van suiker pentose.
Bindingen:
Waterstofbruggen -> tussen beide strengen.
Van der Waalskracht -> tussen gestapelde base.
Hydrofobe interactie -> in de miner groove.
,Elektrostatisch -> tussen DNA en eiwitten.
Tussen C en G zitten 3 waterstofbruggen, tussen A en T zitten 2 waterstofbrug.
Purine = adenine en guanine hebben dubbele ring.
Pyrimidine = thymine cytosine en uracil hebben een enkele ring.
DNA (Deoxyribonucleïnezuur) RNA (Ribonucleïnezuur)
Dubbelstrengs Enkelstrengs
Deoxyribose (H) Ribose (OH)
Thymine (methylgroep) Uracil (geen methylgroep)
Miljoenen baseparen Duizenden baseparen
Stabiel Minder stabiel (kortlevend)
In de kern aanwezig In kern en cytoplasma aanwezig
Informatie opslag Informatieoverdracht
Zowel intronen als exonen Alleen exonen
(Belangrijk om te weten: als er bij een DNA streng niks staat, is het altijd geschreven van ‘5 naar ‘3)
Endosymbiose theorie = eukaryote cellen zijn geevolueerd door symboise met de mitochondrien en
chloroplasten want; deze hebben een eigen circulaire genoom, even groot als bacteriën, eigen ribosomen en
eigen transfer RNA.
De PCR techniek kan uitleggen en gevolgen van wijzigingen in het protocol kan uitleggen
PCR polymerase chain reaction = Het amplificeren van een specifiek stuk DNA. De benodigdheden van de
PCR zijn; DNA sample, DNA primers, vrije nucleotides (dNTP’s), DNA polymerase en een buffer.
Stap 1: Denaturatie = het verhogen van de tempratuur om dubbelstrengs DNA uit elkaar te halen. Dit wordt
gedaan op een tempratuur tussen de 90 en 100 graden. Deze stap duurt ongeveer 30 seconden.
Stap 2: Annealing = de primers binden aan het DNA. De tempratuur hangt af van de primer, tijd = ongeveer 1
min. Als de tempratuur lager is dan het optimum zullen de primers minder specifiek binden (binding kan dan
ook ergens anders plaatsvinden ipv op gewenste sequentie).
Stap 3: Elongatie = DNA polymerase bouwt de nucleotides in. De tempratuur tijdens deze stap is 72 graden.
De tijd hangt af van de hoeveelheid DNA wat gekopieerd moet worden. Bij een te korte elongatie zal er een
te klein stuk geamplificeerd zijn. In de volgende ronde kan de primer niet goed binden en wordt DNA niet
gekopieerd.
, Primers kan ontwerpen en de zaken waar rekening mee gehouden moet worden kan uitleggen
De primers die in de PCR zitten zijn gemaakt van DNA (dit is stabieler dan RNA). De combinatie van
nucleotiden van de primer bepaald bij welke tempratuur de primer bindt. De smelttempratuur Tm is de
tempratuur waarbij de primer loslaat van zijn template. De annealingstempratuur is wanneer de primers
hechten aan de template. Deze tempratuur ligt vaak ongeveer 5 graden onder de smelttempratuur.
De richtlijnen voor primers zijn:
- De lengte van de primers ligt tussen de 17-28 nucleotiden. Langer?= annealing lastiger. Korter?= minder
specifiek.
- De C-G gehalte moet 50-60% zijn. Is dit hoger dan is er een te hoge smelttempratuur, is dit lager dan is de
primer minder specifiek.
- De forward en reverse primer moeten ongeveer dezelfde smelttempratuur hebben.
- Primers moeten aan de ‘3 zijde eindigen op G of C. C/G binding heeft 3 waterstofbruggen en blijven beter
vastzitten. Aan de ‘3 zijde omdat polymerase hier begint met inbouwen.
- Er mogen niet meer dan drie C/G bindingen aan ‘3 uiteinde zitten. Als er meer zitten kan de primer
makkelijk binden aan verkeerde C/G rijke gebieden.
- Er mag geen self annealing (binden aan eigen stukje primer) of primer-dimer (primers binden aan elkaar)
vormen
De primers laten niet los van de template, ook al is tempratuur hoger dan smelttempratuur, doordat
polymerase ze op hun plek houdt.
Namen DNA strengen:
Les avantages d'acheter des résumés chez Stuvia:
Qualité garantie par les avis des clients
Les clients de Stuvia ont évalués plus de 700 000 résumés. C'est comme ça que vous savez que vous achetez les meilleurs documents.
L’achat facile et rapide
Vous pouvez payer rapidement avec iDeal, carte de crédit ou Stuvia-crédit pour les résumés. Il n'y a pas d'adhésion nécessaire.
Focus sur l’essentiel
Vos camarades écrivent eux-mêmes les notes d’étude, c’est pourquoi les documents sont toujours fiables et à jour. Cela garantit que vous arrivez rapidement au coeur du matériel.
Foire aux questions
Qu'est-ce que j'obtiens en achetant ce document ?
Vous obtenez un PDF, disponible immédiatement après votre achat. Le document acheté est accessible à tout moment, n'importe où et indéfiniment via votre profil.
Garantie de remboursement : comment ça marche ?
Notre garantie de satisfaction garantit que vous trouverez toujours un document d'étude qui vous convient. Vous remplissez un formulaire et notre équipe du service client s'occupe du reste.
Auprès de qui est-ce que j'achète ce résumé ?
Stuvia est une place de marché. Alors, vous n'achetez donc pas ce document chez nous, mais auprès du vendeur emmavandervelden79. Stuvia facilite les paiements au vendeur.
Est-ce que j'aurai un abonnement?
Non, vous n'achetez ce résumé que pour €5,50. Vous n'êtes lié à rien après votre achat.
