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Samenvatting Moleculaire Celbiologie: Deel Biochemie - Biomedische Wetenschappen, jaar 2, UvA

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Samenvatting Moleculaire Celbiologie, deel Biochemie van Teixeira de Mattos. Biomedische Wetenschappen, UvA, 2e jaar.

Aperçu 2 sur 9  pages

  • 2 mars 2016
  • 9
  • 2015/2016
  • Resume
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Intro:

Metabole netwerk = alle substraten en producten aan elkaar gekoppeld

4 macromoleculen:

- Polysachariden > gemaakt uit suikers
- Vetten > gemaakt uit vetzuren (en glycerol) > membraanstructuren
- Eiwitten > gemaakt uit aminozuren > activiteit
- Nucleïnezuren (bv DNA, RNA) > gemaakt uit nucleotides > informatie

Condensatie en hydrolyse

Amfifatisch = zowel hydrofiel als hydrofoob deel

Verhouding cel is ongeveer: C4H7O2N (P, S, K, Na)

Stabiele conformatie > lage energetische toestand

Instabiel > hoge energetische toestand

1e wet thermodynamica: Energie kan niet gemaakt worden en gaat niet verloren.
Energy before = energy after

2e wet thermodynamica: Bij een energie-omzetting gaat er altijd een beetje
energie verloren aan entropie (perpetuum mobile is niet mogelijk). Chaos van het
universum neemt toe en het kost energie om orde aan te brengen.

dG=dH-TdS > S=entropie, H=energie-inhoud=enthalpie, G=Gibbs free energie

Reactie kan alleen spontaan verlopen als dG<0 (=exergone reactie)

dG hangt af van:

- De aard van de reactanten
- De concentraties van de reactanten

Koppeling van exergone reactie (dG<0, bv ATP hydrolyse) aan endotherme reactie
(dG>0), kan endotherme reactie laten verlopen



Intro + eiwitstructuur:

Enzymkinetiek > Michaelis-Menten

Km = affiniteitsconstante = de substraatconcentratie V=0.5×Vmax

Zonder enzym: rechtevenredig verband tussen substraatconcentratie en
omzettingssnelheid

, Reactiesnelheid is afhankelijk van:

- Hoeveelheid enzym (mate van genexpressie)
- Temperatuur

Allosterische enzymen = enzymen die een andere conformatie krijgen door
binding van een ligand > de active site kan hierdoor hogere of lagere affiniteit
krijgen voor het substraat

Zuur-base reactie: overdracht H+ van donor naar acceptor

Redox reactie: overdracht van e- van donor (reductor) naar acceptor (oxidator)

Oxidatiereactie = er wordt een elektron afgestaan

Reductiereactie = er wordt een elektron opgenomen



Chiraliteit > spiegelbeeldisomeren

In eiwitten komen altijd L-isomeren van aminozuren voor

Aminozuur bij lage pH > NH3+ en COOH

Neutrale pH > NH2 en COOH = zwitterionic form

Hoge pH > NH3 en COO-



Verschil in elektronegativiteit:

Kleiner dan 0.4 > covalente binding, apolair

Tussen de 0.4 en 1.6 > polaire binding

Boven de 1.6 > ionbinding/elektrostatische binding

- Primaire structuur: nucleotidenvolgorde

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