‘Persoonlijkheid’ van biomoleculen wordt bepaald door hun functionele groepen.
De eigenschappen zijn vervat in alle organische elementen die men aantreft.
3D-structuur is minstens even belangrijk als de organische elementen
➔ Van belang voor de interacties (bv. met eiwitten; zie AcetylcoA)
Vb. 1 belang 3D-structuur:
R-thalidomide S-thalidomide
Organisch en chemisch identiek maar op biochemisch vlak helemaal niet:
S-thalidomide veroorzaakt geboorteafwijking
➔ Werd gegeven tegen ochtendmisselijkheid
➔ Bindt met heel andere eiwitten dan degene die nodig zijn
➔ Gevolg: verstoort ontwikkeling
R-thalidomide: harmless
Vb. 2 belang 3D-structuur:
R-Carvone: smaak van pepermunt
S-Carvone: smaak van karwij
Conclusie: 3D-structuur important as hell!
1
,1.1. Aminozuren
Posities in het AZ aangeven met Griekse letters of nummers.
Zijketen hangt aan de C met de carboxylgroep
α-C (COOH)
ε-C (NH3)
AZ komen voor in een D- of L-vorm (bij ‘dieren’ enkel L-aminozuren).
D-AZ vaak gebruikt door bacteriën voor speciale eiwitten (zie later).
• Geen zijketen (H-atoom)
• Maar 3 verschillende substituenten
Geen assymetrisch C
• Assymetrisch AZ
• Grotere conformationele flexibiliteit:
Rond peptidebinding geen rotatie mogelijk
Bindingen op α-C: wel rotatie mogelijk
Rotatie met H-atoom veel gemakkelijker want kleiner dus weinig kans op botsingen met
andere atomen
Glycine vormt vaak scharnieren (voor het vormen van eiwitten)
Belangrijk voor functie van eiwit
• Inert en alifatisch
• Apolair en hydrofoob grote stabiliteit, geven
structuur aan eiwit
• Geen functionele groepen
• Zijketens clustreren samen
OPM: isoleucine
o Extra asymmetrisch centrum
OPM: methionine
o Thioether
OPM: alanine
Kleinste zijketen (CH3)
➔ Belangrijk voor in vitro mutagenesis / site directed mutagenesis
Welk AZ van eiwit X is belangrijk voor de functie van eiwit X? SDM gebruiken
Ideaal:
Zijketen afknippen zodat het niet meer kan bijdragen tot de functie van het eiwit
(Kan niet)
Equivalent:
In genetische code van eiwit: codon dat voor die functie codeert veranderen door
codon dat codeert voor een ander AZ (hier alanine)
➔ Grote keten wordt vervangen door kleine (CH3)
Indien proteïne nog steeds werking verricht: foute hypothese!
4
Les avantages d'acheter des résumés chez Stuvia:
Qualité garantie par les avis des clients
Les clients de Stuvia ont évalués plus de 700 000 résumés. C'est comme ça que vous savez que vous achetez les meilleurs documents.
L’achat facile et rapide
Vous pouvez payer rapidement avec iDeal, carte de crédit ou Stuvia-crédit pour les résumés. Il n'y a pas d'adhésion nécessaire.
Focus sur l’essentiel
Vos camarades écrivent eux-mêmes les notes d’étude, c’est pourquoi les documents sont toujours fiables et à jour. Cela garantit que vous arrivez rapidement au coeur du matériel.
Foire aux questions
Qu'est-ce que j'obtiens en achetant ce document ?
Vous obtenez un PDF, disponible immédiatement après votre achat. Le document acheté est accessible à tout moment, n'importe où et indéfiniment via votre profil.
Garantie de remboursement : comment ça marche ?
Notre garantie de satisfaction garantit que vous trouverez toujours un document d'étude qui vous convient. Vous remplissez un formulaire et notre équipe du service client s'occupe du reste.
Auprès de qui est-ce que j'achète ce résumé ?
Stuvia est une place de marché. Alors, vous n'achetez donc pas ce document chez nous, mais auprès du vendeur tinakosari. Stuvia facilite les paiements au vendeur.
Est-ce que j'aurai un abonnement?
Non, vous n'achetez ce résumé que pour €8,49. Vous n'êtes lié à rien après votre achat.