Hoofdstuk 16: RNA
• Algemene eigenschap mRNA: onstabiel (+ grote lengtevariatie)
⤷ Hoge “turnover” nodig voor toelaten regulatie
→ Stabiliteit kan beïnvloed worden (zowel ⊕ als ⊝) door binding eiwitten
• mRNA in prokaryoten:
→ Halfwaardetijd: ong. 2 min.
→ Transcript niet geprocessed: ribosomen binden al tijdens transcriptie1
• mRNA in eukaryoten (algemeen)
→ Primair transcript = hnRNA → processing2 → mRNA →transport naar cytoplasma
▪ Verlaat de kern niet ⤷ ▪ Halfwaardetijd: 6 - 24 uur
▪ Halfwaardetijd: ong. 30 min.
• Interne modificatie bij eukaryote mRNA’s: splicing
→ Introns verwijderd uit primair transcript
• Modificaties aan uiteinden van eukaryotische mRNA’s:
→ 5’ “cap”:
▪ Transcript ong. 20 – 30 lang => toevoeging cap-structuur aan 5’-einde
▪ 7-methyl-guanine met fosfordiësterbinding op 1ste nucleotide mRNA-keten
▪ Uitgevoerd door guanylyl-transferase en guanine-7-methyl-transferase
▪ Nadien mogelijk bijkomende methylaties
▪ Rol bij transport van kern naar cytoplasma + bescherming tegen nucleasen +
herkenningsplaats voor ribosomen
→ Polyadenylatie:
▪ Afknippen 3’-uiteinde door endonucleolytische knip
⤷ ong. +11/+30 van polyadenylatiesignaal (consensussequentie: 5’ AAUAAA 3’)
▪ Toevoeging van polyA-staart (ong. 200 adenines)
▪ Belangrijk voor transport naar cytoplasma, translatie en bescherming tegen afbraak3
• rRNA: belangrijkste component ribosomen
→ Kleine en grote subeenheid (analoog in alle organismen)
→ RNA heeft katalytische + structurele functie binnen ribosoom (“geraamte”)
→ Op basis van rDNA-sequenties kan men evolutionaire boom maken
⤷ Geconserveerde sequenties + variabele gebieden
⤷ ITS (internal transcribed spacer) = spacer tussen rRNA-codes
⤷ Primers (voor PCR) worden voor geconserveerde gebieden gemaakt
• Bij pro- en eukaryoten: alle info voor rRNA in 1 transcriptie-eenheid
⤷ Behalve 5S bij eukaryoten
→ Eerst en voor kleine subeenheid (16S4 voor prokaryoten, 18S voor eukaryoten)
→ Nadien spacer (ITS)
→ Nadien gen voor grote subeenheid (23S voor prokaryoten, 18S voor eukaryoten)
→ In de spacer kan tRNA-gen voorkomen bij prokaryoten
→ Vaak zijn er meerdere kopieën van dit gen => multigenfamilie
⤷ 18S/5,8S/28 in clusters t.h.v. nucleolaire organisatieregio’s (NOR) v chromosomen
⤷ 5S-genen buiten NOR’s in clusters
• Transcriptie en processing van rRNA
→ Genen in 1 transcriptie-eenheid => samen primair transcript (pre-rRNA)
1
Koppeling van transcriptie en translatie
2
Zowel aan 5’ als aan 3’ kant en ook intern
3
Histon-mRNA’s hebben geen polyA-staart → korte levensduur
4
Grootte uitgedrukt in S (Svedbergsedimentatiecoëfficiënt)
Les avantages d'acheter des résumés chez Stuvia:
Qualité garantie par les avis des clients
Les clients de Stuvia ont évalués plus de 700 000 résumés. C'est comme ça que vous savez que vous achetez les meilleurs documents.
L’achat facile et rapide
Vous pouvez payer rapidement avec iDeal, carte de crédit ou Stuvia-crédit pour les résumés. Il n'y a pas d'adhésion nécessaire.
Focus sur l’essentiel
Vos camarades écrivent eux-mêmes les notes d’étude, c’est pourquoi les documents sont toujours fiables et à jour. Cela garantit que vous arrivez rapidement au coeur du matériel.
Foire aux questions
Qu'est-ce que j'obtiens en achetant ce document ?
Vous obtenez un PDF, disponible immédiatement après votre achat. Le document acheté est accessible à tout moment, n'importe où et indéfiniment via votre profil.
Garantie de remboursement : comment ça marche ?
Notre garantie de satisfaction garantit que vous trouverez toujours un document d'étude qui vous convient. Vous remplissez un formulaire et notre équipe du service client s'occupe du reste.
Auprès de qui est-ce que j'achète ce résumé ?
Stuvia est une place de marché. Alors, vous n'achetez donc pas ce document chez nous, mais auprès du vendeur ameliakirkov. Stuvia facilite les paiements au vendeur.
Est-ce que j'aurai un abonnement?
Non, vous n'achetez ce résumé que pour €9,79. Vous n'êtes lié à rien après votre achat.