Garantie de satisfaction à 100% Disponible immédiatement après paiement En ligne et en PDF Tu n'es attaché à rien
logo-home
Recherché précédemment par vous
Recherché précédemment par vous
logo
Samenvatting Overzicht Bio informatica Cursus (Behaald Resultaat: 16/20) €6,49   Ajouter au panier
Accédez rapidement à
Aperçu
  2.  
  3. Universiteit Antwerpen (UA)
  4.  
  5. Biomedische Wetenschappen
  6.  
  7. Bio-informatica

Resume

Samenvatting Overzicht Bio informatica Cursus (Behaald Resultaat: 16/20)
 16 vues  0 fois vendu

Dit document bevat een overzicht van alle onderwerpen van bio informatica gegeven in academiejaar . Ik heb hiervoor een overzicht gemaakt van alle algoritmes en dit al kort uitgelicht. Verder bevat het per les en practica een overzicht van de belangrijkste onderdelen en verwijzingen naar de dia's w...

[Montrer plus]

Aperçu 1 sur 3  pages

Infos sur le Document

  • 3 novembre 2021
  • 3
  • 2021/2022
  • Resume

Sujets

École, étude et sujet

Tous les documents sur ce sujet (10)

Vendeur

avatar-seller
lemmeslodders

Avis reçus

Aperçu du contenu

Ex-examenvragen / Voorbeeldvragen

1. Dot matrix methode uitvoeren met zowel korte als lange woordlengte. Hoe zie je
meteen of er een hoge similariteit is (duidelijke diagonaal)? Wat is ‘woordlengte’? Wat
is het verschil tussen een korte en een lange woordlengte en hoe bepaal je of je een
korte of een lange wilt gebruiken? Duid aan (indien aanwezig): insertie, mismatch,
repeat en palindroom sequentie.

2. Needleman – Wunsch (NW) of Smith – Waterman (SW) alignement met B.A.B.A.
uitvoeren. Hoe zie je meteen of er een hoge similariteit is (groene diagonaal)? Hoe komt
deze matrix tot stand? Duid aan (indien aanwezig): insertie, mismatch en deletie.

3. Needleman – Wunsch en Smith – Waterman alignement met EMBOSS Needle and
Water,
met enerzijds twee sterk gerelateerde proteïnen en anderzijds met twee zwak
gerelateerde proteïnen. Wat is het verschil tussen een NW en een SW alignement?
Verklaar de verschillende parameters die worden weergegeven (bv. Gap penalty).
Vergelijk beide methodes a.d.h.v. de gegeven scores, alignement van de domeinen (zelf
opzoeken),… en verklaar waarom NW of SW een betere keuze is.

4. Gebruik Ugene om vijf opgegeven sequenties te aligneren op drie verschillende
manieren (bv. Clustal Omega, Kalign en MAFFT). Vergelijk de drie resultaten en bepaal
welke methode de beste is.

5. Kies via Pfam twee eiwitten uit eenzelfde eiwitfamilie en kies zelf een methode om de
sequenties ervan te aligneren. Duid in het resultaat belangrijke kenmerken aan (bv.
Een eiwitdomein). Zijn deze kenmerken correct gealigneerd door het gekozen
programma?

6. Gebruik één van de twee gekozen eiwitsequenties uit bovenstaande opdracht om een
BLAST search uit te voeren. Zoek een eiwit dat nog niet tot een eiwitfamilie toegekend
is en toon de BLAST resultaten ervan (bv. Max score, total score, E-value…). Zou je dit
eiwit onder jou gekozen eiwitfamilie klasseren? Waarom wel of niet?

7. Kies via Pfam een eiwit uit de Laminine familie. Zoek op welke domeinen er allemaal
voorkomen in deze eiwitfamilie en welke functie ze hebben. Geef overzichtelijk de
domeinen en motieven weer van het door jou gekozen proteïne (zoeken in Interpro,
Pfam, Uniprot,…) en verklaar a.d.h.v. de aanwezige domeinen de functie van het eiwit.

8. Zoek via PDB de secundaire structuur op van één van de domeinen uit de Laminine
familie. Vermeld ook de methode die gebruikt werd voor de structuurbepaling en
gegevens i.v.m. de publicatie van het artikel.

9. Een oefening i.v.m. Gene Ontology (GO). Zoek via Unitprot domeinen van eiwitten uit
de Laminine familie die instaan voor de verschillende categorieën van GO (biologisch
proces, moleculaire functie en lokalisatie).

Les avantages d'acheter des résumés chez Stuvia:

Qualité garantie par les avis des clients

Qualité garantie par les avis des clients

Les clients de Stuvia ont évalués plus de 700 000 résumés. C'est comme ça que vous savez que vous achetez les meilleurs documents.

L’achat facile et rapide

L’achat facile et rapide

Vous pouvez payer rapidement avec iDeal, carte de crédit ou Stuvia-crédit pour les résumés. Il n'y a pas d'adhésion nécessaire.

Focus sur l’essentiel

Focus sur l’essentiel

Vos camarades écrivent eux-mêmes les notes d’étude, c’est pourquoi les documents sont toujours fiables et à jour. Cela garantit que vous arrivez rapidement au coeur du matériel.

Foire aux questions

Qu'est-ce que j'obtiens en achetant ce document ?

Vous obtenez un PDF, disponible immédiatement après votre achat. Le document acheté est accessible à tout moment, n'importe où et indéfiniment via votre profil.

Garantie de remboursement : comment ça marche ?

Notre garantie de satisfaction garantit que vous trouverez toujours un document d'étude qui vous convient. Vous remplissez un formulaire et notre équipe du service client s'occupe du reste.

Auprès de qui est-ce que j'achète ce résumé ?

Stuvia est une place de marché. Alors, vous n'achetez donc pas ce document chez nous, mais auprès du vendeur lemmeslodders. Stuvia facilite les paiements au vendeur.

Est-ce que j'aurai un abonnement?

Non, vous n'achetez ce résumé que pour €6,49. Vous n'êtes lié à rien après votre achat.

Peut-on faire confiance à Stuvia ?

4.6 étoiles sur Google & Trustpilot (+1000 avis)

80796 résumés ont été vendus ces 30 derniers jours

Fondée en 2010, la référence pour acheter des résumés depuis déjà 14 ans

Commencez à vendre!
€6,49
  • (0)
  Ajouter