Resume
Samenvatting Inleiding systeembiologie
- Cours
- Établissement
Samenvatting van het vak Inleiding systeembiologie, gegeven tijdens het 3e jaar van Medische natuurwetenschappen.
[Montrer plus]
Vendeur
S'abonner
boekentijger
Avis reçus
Aperçu du contenu
Balans opstellenK1+: deze reactie gaat naar rechts Massa actie kinetiek
K1-: deze reactie gaat naar links Snelheden
K2: deze reactie gaat maar 1 kant op, in dit geval naar rechts. Evenwicht & steady-state
Hoofdletters: naam
Kleine letters: concentratie
E: enzym
S: substraat Dit is een gesloten systeem, want
ES: gebonden enzym en substraat er wordt niks aan- of afgevoerd.
P: product
S: als een stof onderstreept is, dan betekent het dat het een constante
concentratie heeft. Er wordt dus steeds extra S toegevoegd om de
concentratie gelijk te houden. Voor deze stoffen hoef je nooit een balans
op te stellen!
1. Systeem definiëren
Parameter = constant
Variabele= niet constant
2. Balans opstellen
3. Kinetiek bepalen
V1 en V2 invullen
4. Stationaire punten bepalen
Stationaire toestand = wanneer de r.c. niet meer verandert
en dus geldt dx/dt = 0. Dit is op het snijpunt van V1 en V2.
Rate characteristic = een grafiek waarin te zien is hoe
processen afhangen van X.
Er zijn 2 soorten:
1. Massa actie kinetiek
2. Enzym kinetiek
Enzym kinetiek gebruik je als er enzym katalysatie bij betrokken is. Dit kan zijn: het vormen van een complex tussen 2
eiwitten / het binden van een ligand aan een receptor / spontane chemische reactie.
Belangrijk:
• De reactie gaat maar 1 kant op, dus gebruik je het
proces k1+.
• 2x moet je noteren als x2 in de balans.
• Je begint met 2 x en eindigt met 1 x, er gaat dus 1 x
af. Hierdoor schrijf je in de balans een - . Dit noem je
de storcheometrische coëfficiënt.
Summary Pagina 1
, Er zijn 2 soorten stationary states:
1. Steady-state
2. Equilibrium (evenwicht)
Voorbeelden:
S→X→P Heeft equilibrium. Uitleg: S, X en P zijn variabelen. Als je S toevoegt wordt dit omgezet in X. X wordt
omgezet in P. De reactie stopt wanneer alle stoffen in evenwicht zijn. De bijbehorende balansen zijn:
ds/dt= -v1. dx/dt=v1-v2. dp/dt=v2. Je kan het ook op een andere manier uitleggen; bij steady state geldt
er dat ds/dt=0. Dit betekent dat ds/dt = -v1 = 0. De snelheid van reactie 1 is dus 0. Als de snelheden 0 zijn,
is er sprake van evenwicht.
S→X→P Heeft equilibrium. Uitleg: stel je zet S op 1 dan wordt dit omgezet in X. X wordt omgezet in P. Er ontstaat
een evenwicht als alle stoffen een concentratie van 1 hebben. De bijbehorende balansen zijn: dx/dt = v1 -
v2. dp/dt = v2. Let op: je stelt dus geen balans op voor S.
S→X→P Heeft (meestal) een steady-state, maar dit is afhankelijk van de concentraties van S en P. Er is een
constante stroom door het systeem. Op het moment dat v1=v2 heb je een steady-state. Stel dat er geldt
v=0 op het moment van v1=v2, dan krijg je equilibrium. Dit is dus alleen bij specifieke/ unieke waarden
van S en P.
Heeft steady-state. Uitleg: er geldt V kinase = Vp, dus er is een steady state.
Volgorde van stappen tot systeembeschrijving?
1. Variabelen en parameters vaststellen
2. Balans opstellen
3. Kinetiek bepalen
4. Stationaire punten bepalen
Geef de balans van
dx/dt = v1 - v2
dy/dt = v2 - v3
dz/dt = v3 - v4
n.b. Z heeft ook invloed op X, maar dat hoef je niet te geven bij de balans. Als er gevraagd wordt om de
snelheden (rate equation), dan moet je wel rekening houden met Z.
Geef de balans van:
dx/dt = v1 - v2
dy/dt = v3 - v4
n.b. L heeft geen streep eronder dus je zou hier ook een balans voor kunnen opstellen, maar er zijn
verder geen stoffen die hem beïnvloeden. De stippellijn betekent regulatoire interactie, het heeft dus
invloed op een snelheid.
Summary Pagina 2
Les avantages d'acheter des résumés chez Stuvia:
Qualité garantie par les avis des clients
Les clients de Stuvia ont évalués plus de 700 000 résumés. C'est comme ça que vous savez que vous achetez les meilleurs documents.
L’achat facile et rapide
Vous pouvez payer rapidement avec iDeal, carte de crédit ou Stuvia-crédit pour les résumés. Il n'y a pas d'adhésion nécessaire.
Focus sur l’essentiel
Vos camarades écrivent eux-mêmes les notes d’étude, c’est pourquoi les documents sont toujours fiables et à jour. Cela garantit que vous arrivez rapidement au coeur du matériel.
Foire aux questions
Qu'est-ce que j'obtiens en achetant ce document ?
Vous obtenez un PDF, disponible immédiatement après votre achat. Le document acheté est accessible à tout moment, n'importe où et indéfiniment via votre profil.
Garantie de remboursement : comment ça marche ?
Notre garantie de satisfaction garantit que vous trouverez toujours un document d'étude qui vous convient. Vous remplissez un formulaire et notre équipe du service client s'occupe du reste.
Auprès de qui est-ce que j'achète ce résumé ?
Stuvia est une place de marché. Alors, vous n'achetez donc pas ce document chez nous, mais auprès du vendeur boekentijger. Stuvia facilite les paiements au vendeur.
Est-ce que j'aurai un abonnement?
Non, vous n'achetez ce résumé que pour €3,89. Vous n'êtes lié à rien après votre achat.
Peut-on faire confiance à Stuvia ?
4.6 étoiles sur Google & Trustpilot (+1000 avis)
77858 résumés ont été vendus ces 30 derniers jours
Fondée en 2010, la référence pour acheter des résumés depuis déjà 14 ans