Summary Molecular Biology of the Cell (5234MOBC6Y) partial exam 1+2
Notes for all lectures of cell metabolism and metabolic control
Cellen en Weefsels hoofdstuk 6 Transcriptie en RNA processing
Tout pour ce livre (21)
École, étude et sujet
Universiteit Utrecht (UU)
Biologie
Cellen en Weefsels
Tous les documents sur ce sujet (80)
Vendeur
S'abonner
thomvd
Avis reçus
Aperçu du contenu
Cellen en weefsels – DT2
Hoofdstuk 13: Intracellular membrane traffic
Voordelen intracellulaire compartimenten:
-verschillende milieus
-lysosomen hoge zuurgraad -> functionaliteit enzymen
-membraanvergroting
-ER groot bij cellen die veel secretie doen
-geconcentreerde reactanten -> substraten/enzymen/cofactoren
Wat maakt compartimenten verschillend:
-eiwitcompositie
-lipidecompositie
-pH en ionische concentraties
Transport tussen componenten endomembraansysteem is vesiculair
-maakt uitwisselen componenten mogelijk zonder identiteitsverlies
-lumen meeste compartimenten zijn topologisch gelijk aan elkaar en de buitenkant van de cel
-secretie: eiwitmoleculen van ER -> endosomen -> lysosomen of van ER -> plasmamembraan
-endocytose: plasmamembraan -> endosomen -> (late endosomen -> lysosomen
Monomerische GTPases van de Rab familie controleren vesiculair transport en docking
-effectors: motoreiwitten, tethers, membraan fusie eiwitten
-GEFs: guanine exchange factor (activator) -> RabA membraan patch assembly
-RabA rekruteert ook GEF voor RabB -> RabB rekruteren op membraan
-hierbij zit ook een GAP voor RabA
-GAPs: GTPase activating protein (inactivatie) -> RabA GTP hydrolyse
-RabA membraan patch valt uit elkaar en vervangen door RabB
-volgende GEF door RabB vervolgt sequentie
-cascades aan eiwitactivaties/inactivaties
-elk compartiment heeft een eigen Rab -> sorteren organellen
1
,Eiwit specifiteit in endomembraan compartimenten: Rab eiwitten
-v-SNARE (vesicle) & t-SNARE (targeting)
-integrale membraaneiwitten
-moeten samenkomen voor fuseren membraan
-Rab-GTP (Rab eiwit) wordt herkent door tethering eiwitten (Rab effector) en vesicles kunnen docken
-conformatieverandering (GTP -> GDP) door Rab GAP brengt vesicle bij membraan
-dan kunnen v-SNARE met t-SNARE interactie aangaan
-Rab-GDP dissociatie inhibitor (GDI) bindt Rab-GDP zodat deze weer geactiveerd kan worden
-Rab3A, Rab5, Rab7 onthouden
Exocytose synaptische vesicles: via SNARES
-trans-SNARE (SNAP25 + syntaxin) complex dockt vesicle op plasmamembraan via v-SNARE
(synaptobrevin)
-synaptotagmine (Ca2+ sensor) en complexin moduleren de SNARES
-openen bij binden Ca2+ en halen block eraf
2
,Vorming Rab5 domein op endosoom membraan
-inactieve Rab5-GDP geactiveerd door Rab5-GEF (GDP->GTP, GDI laat hierbij los)
-conformatieverandering en membraaninsertie Rab5-GTP
-mogelijk door lipide groep die vrijkomt
-actieve Rab5 activeert PI3 kinase -> PI(3)P formatie vanuit PI (fosfaatgroep op lipide)
-Rekruteren meer Rab-5-GEF (positieve feedback)
-Rekruteren Rab effector eiwitten (bv. Tethering)
-hierdoor Rab5-geassocieerde membraan patch
-cyclus GTP hydrolyse en GDP-GTP uitwisseling reguleert Rab patches
Verschillende fosfatidylinositol lipiden markeren organellen en membraandomeinen
-plextrine homologie (PH) domein bindt specifieke fosfolipiden
-hiermee lokalisatie weergeven
-een individueel transport vesicle fuseert hierdoor met één type membraan
-bv. Secratory vesicles: PI(4)P fuseren met membraan als PI-5-Kinase dit omzet in PI(4,5)P2, deze
rekruteert adaptines die de clathrine-coated pit vormen -> PI(5P)-fosfatase hydrolyseert PI(4,5)P2 en
verzwakt binding waardoor vesicle uncoating begint
3
, Lipide rafts zijn plekken in een cel met bepaalde functie
-hierin liggen phosphatidylinositol lipiden georganiseerd
-1:1:1 mix van phosphatidylcholine, sphingomyeline en cholesterol lokaliseren zich in lipide domeinen
(rafts)
-rood cirkeltje in afbeelding = raft
-dit gebeurd dus ook in gewone cellen
Phosphatidyl inositol lipiden
-glycerol backbone met 3 OH (hydroxyl) groepen
-twee vetzuurstaarten
-3’ positie zit een fosfaatgroep met inositol
-positie 3-4-5 glycerol backbone van inositol worden gefosforyleerd -> PIP2
-meestal PI(4,5)2
-via fosfatases (groen – bv. PI 3-Kinase PIP2 -> PIP3) en kinases (rood - bv. PI 3-Kinase door
Rab5)
-vaak specifieke kinases/fosfatases bij verschillende
membraandomeinen/compartimenten
-na vormen samenstelling blijft deze bestaan
4
Les avantages d'acheter des résumés chez Stuvia:
Qualité garantie par les avis des clients
Les clients de Stuvia ont évalués plus de 700 000 résumés. C'est comme ça que vous savez que vous achetez les meilleurs documents.
L’achat facile et rapide
Vous pouvez payer rapidement avec iDeal, carte de crédit ou Stuvia-crédit pour les résumés. Il n'y a pas d'adhésion nécessaire.
Focus sur l’essentiel
Vos camarades écrivent eux-mêmes les notes d’étude, c’est pourquoi les documents sont toujours fiables et à jour. Cela garantit que vous arrivez rapidement au coeur du matériel.
Foire aux questions
Qu'est-ce que j'obtiens en achetant ce document ?
Vous obtenez un PDF, disponible immédiatement après votre achat. Le document acheté est accessible à tout moment, n'importe où et indéfiniment via votre profil.
Garantie de remboursement : comment ça marche ?
Notre garantie de satisfaction garantit que vous trouverez toujours un document d'étude qui vous convient. Vous remplissez un formulaire et notre équipe du service client s'occupe du reste.
Auprès de qui est-ce que j'achète ce résumé ?
Stuvia est une place de marché. Alors, vous n'achetez donc pas ce document chez nous, mais auprès du vendeur thomvd. Stuvia facilite les paiements au vendeur.
Est-ce que j'aurai un abonnement?
Non, vous n'achetez ce résumé que pour €8,96. Vous n'êtes lié à rien après votre achat.